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Servicio de Bioinformatica

La unidad de Bioinformática se crea para dar respuesta a la creciente demanda de manipulación y análisis de datos procedentes fundamentalmente de las nuevas plataformas de secuenciación masiva (Next-Generation Sequencing, NGS). Sus funciones principales son:

 

  • Dar el soporte necesario para el análisis de resultados de NGS.
  • La supervisión de los servidores de los secuenciadores, del clúster de computación y del sistema de almacenamiento de datos.
  • Asimismo, la unidad pretende formar y colaborar con los diferentes usuarios en el uso y desarrollo de herramientas bioinformáticas que sean de utilidad en cada caso.

Los principales servicios ofrecidos por la Unidad de Bioinformática del Instituto i+12 son:

 

  • Servicio de consultoría para el diseño de experimentos de secuenciación para los equipos disponibles en el Instituto i+12.
  • Procesamiento y análisis e interpretación de resultados procedentes principalmente de las plataformas de NGS del i+12.

El equipamiento científico con el que cuenta la Unidad de Bioinformática del Instituto i+12 es el siguiente:

 

  • Servidores secuenciadores NGS. i+12-Genómica:
    • Dell Precision T7500: 2x Intel Xeon X5650 (6 cores), 48GB RAM, 11TB.
    • Dell PowerEdge T630: 2x Intel Xeon E5-2680v3 (12 cores), 128GB RAM, 28TB.
    • HP Z400: Intel Xeon W3550 (4 cores), 12GB RAM, 620GB.
  • Clúster “Quimera” i+12-CPD H12O:
    • 2 Nodos de gestión R423-E3: 4x Intel Xeon E5-2650v2 (8 cores), 128GB RAM.
    • 4 Servidores de cómputo R421-E3: 8x Intel Xeon E5-2650v2 (10 cores), 320GB RAM, 2x GPU K20m (5GB).
    • Cabina almacenamiento: E2700 (130TB).
  • Estación de trabajo Dell T7610 (2x Intel Xeon E5-2630v2 (6 cores), 64GB RAM, 2,3TB). Grupo Enfermedades Raras, Mitocondriales y Neuromusculares.
  • Estación de trabajo Dell T7610 (2x Intel Xeon E5-2630v2 (6 cores), 64GB RAM, 2,3TB). Grupo Genética y Herencia.
  • Estación de trabajo Dell T7600 (2x Intel Xeon E5-2630 (6 cores), 64GB RAM, 2,4TB). Grupo Hematología Traslacional.
  • NAS Synology: RS18017XS+ (100TB), DS1813+ (38TB) y DS415Play (6TB).

Coordinador: Francisco Javier Fernández Martínez (ffernandezm@salud.madrid.org)

Responsable técnico: Aitor Delmiro Magdalena (adelmiro@h12o.es)