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Servicio de Proteomica

El Instituto i+12 cuenta con el apoyo de la Unidad de Proteómica desde el año 2007. Esta Unidad tiene como objetivos principales prestar servicio y apoyo a los investigadores, fomentar la investigación científica y el desarrollo tecnológico continuo en el área de la Proteómica.

La Proteómica proporciona un conjunto de herramientas que permiten el estudio de la patogénesis molecular de enfermedades, así como la identificación de biomarcadores específicos que permitan diagnosticar, clasificar, pronosticar y predecir enfermedades, definir nuevas dianas terapéuticas o predecir el comportamiento ante fármacos.

La Unidad de Proteómica ofrece a los investigadores diferentes servicios de proteómica así como seminarios y cursos de formación.

El Laboratorio de proteómica ofrece una diversa gama de servicios analíticos de proteínas, y muchos de los mismos requieren la contratación de servicios externos. Además, en su mayoría  estos servicios requieren una estrecha interacción técnico-científico con el usuario para determinar la mejor estrategia analítica a utilizar.

La prioridad de los análisis será, en todos los casos, para las muestras enviadas por los grupos de investigación del Instituto y de otras entidades académicas adscritas al mismo. Los análisis solicitados por usuarios externos (otras instituciones de investigación y compañías privadas) estarán sujetos a la evaluación de la Responsable de la Unidad.

La Unidad de Proteómica ofrece apoyo y servicio de las siguientes tecnologías:

  1. Separación de proteínas y análisis de expresión diferencial.
    1. Electroforesis 2D para análisis convencional de mezclas de proteínas en gel.
    2. Electroforesis 2D para análisis diferencial cuantitativo “Tecnología DIGE”.
    3. Marcaje múltiple isobárico.
  2. Identificación de proteínas tanto en gel como en solución.
  3. Separación y análisis de Complejos Proteicos en condiciones nativas: BLUE NATIVE. Este análisis se realiza tanto en 1D como en 2D y supone la transferencia de las mismas a membrana o la tinción de los geles para posterior identificación de proteínas.
  4. Asistencia teórico-práctica en el diseño particular de cada tipo de inmunoblotting.
  5. Análisis de expresión diferencial monodimensional.

Para el desarrollo de estas técnicas y metodologías, la Unidad de Proteómica cuenta en la actualidad con el siguiente equipamiento de alta tecnología:

Sistema de electroforesis Bidimensional EttanTM, 2D-PAGE

  • Este sistema está formado por la unidad IPGphor™ III, que integra el sistema de isoelectroenfoque para realizar la primera dimensión. Permite la aplicación de tiras de pH inmovilizado usando el soporte de IPGphor™ Manifold, que permite correr simultáneamente hasta 12 tiras. La unidad IPGphor™ III incluye un software de control que genera gráficas donde quedan monitorizados los cambios de voltaje, corriente y voltios-hora que van ocurriendo a lo largo del programa de isoelectroenfoque.
  • La unidad de electroforesis DALTsix, donde se va a realizar la segunda dimensión, está formada por una cubeta de electroforesis que permite correr hasta seis geles a la vez, reduciendo por tanto la variabilidad experimental en cada uno de esos geles. Además aporta un soporte de montaje de geles que también está diseñado para polimerizar hasta seis geles a la vez.
  • Ambos equipos son estabilizados mediante el sistema MultiTemp ™ III (GE Healthcare), que proporciona un control de temperatura fiable y reproducible mediante la circulación de líquidos a temperatura constante a los equipos de electroforesis externos. La generosa capacidad de 200 W de enfriamiento permite que se conecten hasta dos aparatos de electroforesis vertical a la vez para mayor reproducibilidad de los ensayos.

Fraccionador por Isoelectroenfoque en líquido, 3100 OFFGEL (Agilent)

  • Isoelectroenfoque en fase líquida preparativo: el fraccionador Offgel Agilent 3100 resuelve mezclas complejas de proteínas o péptidos según su punto isoeléctrico (pI) consiguiendo fraccionamientos de alta resolución. Las fracciones resultantes quedan en solución, lo que hace mucho más fácil su recuperación para el análisis LC/MS o en geles convencionales. Los resultados son altamente reproducibles.

2100 Bioanalyzer (Agilent)

  • Sistema basado en la electroforesis capilar microfluídica, de tal manera que puede determinar, cuantificar y mostrar la calidad de los extractos proteicos totales.

Equipo para análisis y documentación de geles ImageQuant LAS 4000 (GE Healthcare)

  • Sistema de análisis de imágenes automatizado que combina una óptima captura y análisis de imágenes con el software ImageQuantTL. Este sistema utiliza una cámara CCD de 3,2 megapíxeles que permite la captura de imágenes digitales de geles y membranas quimioluminiscentes, teñidos o fluorescentes, con una resolución efectiva de 6,3 megapíxeles.

Equipo para análisis y documentación de geles ChemiDoc MP Imaging System (Bio Rad)

  • Fotodocumentador diseñado para cubrir aplicaciones de fluorescencia multiplex, quimioluminiscencia y otras aplicaciones generales de documentación de geles mediante cámara CCD.

Equipo para análisis y documentación de geles Gel DocTM EZ (Bio Rad)

  • Sistema de análisis de imágenes compacto y automatizado que combina una óptima captura y análisis de imágenes con el software Image Lab. Permite documentar mini-geles teñidos con colorantes fluorescentes o con colorantes visibles, placas fotográficas y geles libres de tinción (Stain free de Bio-Rad).

ImageScanner III (GE Healthcare)

  • Escáner de alta resolución para digitalización y densitometría de los geles con tinciones visibles.

Extractor de ácidos nucleicos Maxwell 16 de Promega

  • Extractor de proteínas con colas de polihistidina que permite disminuir el tiempo de purificado de este tipo de proteínas marcadas a la vez que el procesado de un mayor número de muestras.

La responsable de la Unidad es la Dra. Inés García-Consuegra Galiana, Técnico Superior de Apoyo a la Investigación. La Unidad se encuentra ubicada en la Planta 0 del Centro de Investigación del Hospital Universitario 12 de Octubre.

Datos de contacto:

  • e-mail: inesgcg@h12o.es
  • Teléfono: 91 390 8000/ Ext: 1465
  • Fax: 91 390 8455